Os bagels podem ser guardados na despensa de um a dois dias. É melhor consumi-los dentro de três meses após serem armazenados no freezer.
Guarde os bagels em temperatura ambiente em um saco plástico transparente e lacrado antes de colocá-los na despensa. Para armazenar bagels no freezer, coloque-os em um saco freezer resistente, embrulhe-os em papel alumínio ou embrulhe-os em filme freezer. Mantenha o freezer a 0 graus Fahrenheit para mantê-los frescos pelo maior tempo possível. Não guarde bagels na geladeira por muito tempo, pois eles podem secar e estragar.