O molho de queijo Nacho pode ser congelado após o uso e descongelado em uma data posterior para ser usado novamente. Se preservado desta forma, pode ser guardado e consumido por um período de 6 meses.
A maneira mais eficiente de congelar o molho de queijo nacho é colocando o molho em um recipiente hermético e armazenando-o em uma prateleira dentro do freezer. É importante descongelar o molho um dia antes de usá-lo novamente, colocando-o na geladeira por várias horas. Quando descongelado, o molho pode assumir uma cor diferente, pois o processo de congelamento pode causar a separação dos óleos. Para consertar, aqueça o queijo no micro-ondas e mexa bem.