Clam chowder pode ser armazenado no congelador. Congelar clam chowder o mantém fresco por muito mais tempo do que na refrigeração e dura de quatro a seis meses quando congelado corretamente.
O ensopado de mexilhões deve ser colocado em um recipiente hermético ou saco para freezer antes de ser armazenado no congelador. Antes de congelá-lo, ele precisa esfriar até a temperatura ambiente. No entanto, não deve ser deixado de fora por mais de duas horas. A melhor maneira de descongelar a sopa congelada é colocar o saco ou recipiente com a sopa em uma tigela grande de água quente por vários minutos. Assim que a sopa começar a descongelar, coloque-a em uma panela e aqueça-a novamente no fogão.