Os caroços do abacate não são venenosos para os humanos em pequenas quantidades, mas contêm uma toxina fungicida chamada persin, que pode prejudicar animais domesticados. A persina é um composto solúvel em óleo encontrado nas folhas, cascas e caroços de abacates.
Folhas e sementes de abacate são prejudiciais quando ingeridas em grandes quantidades, mas até 2014, poucos casos de toxicidade foram relatados. Os caroços do abacate são especialmente tóxicos para cavalos, gado, cabras e pássaros. Cães e gatos mostram leves sinais de doença após comerem grandes quantidades de polpa e cascas de abacate, e comer os caroços pode causar obstrução gástrica. Embora parte do persin penetre na polpa dos abacates a partir dos caroços e da casca, a concentração tende a ser baixa. Pessoas com alergia a látex, banana, melão e pêssego podem ser alérgicas a abacates.