Os cogumelos têm a capacidade de secretar exoenzimas, que digerem matéria orgânica fora do corpo do fungo. Isso permite que eles consumam uma grande variedade de materiais para nutrição. As adaptações são específicas para o tipo de cogumelo. Os cogumelos morel, por exemplo, são capazes de sobreviver a condições climáticas adversas com um esclerócio, um componente que cresce no subsolo e protege o micélio do fungo até que as condições o permitam.
Os cogumelos Morel têm vários outros tipos de adaptações. O micélio primário e secundário permite que ele se alimente das raízes das árvores para adquirir nutrição. O P. cubensis e vários cogumelos da ordem Agaricales possuem faces inferiores gueladas que lhes permitem produzir muitos basidiósporos ao mesmo tempo. As guelras podem liberar facilmente esses esporos girando-se de forma que fiquem paralelos à gravidade. Os fungos Auricularia auricula-judae apresentam uma adaptação que permite resistir a períodos de seca. Ele contém hifas, que são redes de minúsculos filamentos. Esses filamentos são grandes e capazes de se expandir mais do que aqueles encontrados em outros tipos de fungos. Quando há um período de seca, as paredes das hifas se rompem e se restringem, fazendo com que o fungo encolha. Quando a umidade está disponível, as paredes se expandem novamente e retornam o fungo à sua forma original.