A carne de tubarão não é totalmente saudável, pois pode conter altos níveis de mercúrio. De acordo com um relatório da Agência de Proteção Ambiental dos Estados Unidos em 2004, o tubarão foi classificado junto com o peixe azulejo, a cavala e a cavala. o peixe-espada contém altos níveis de mercúrio. O relatório da EPA passou a aconselhar as pessoas a não comerem tubarão.
Um relatório anterior da CNN observou que os níveis de mercúrio na carne de tubarão podem causar cegueira, perda de coordenação e morte. De 124 tubarões amostrados pelo Centro de Pesquisa de Tubarões do Laboratório Marinho Mote, cerca de um terço continha níveis de mercúrio em concentrações maiores do que o nível de ação da Food and Drug Administration dos EUA. O FDA, a EPA e a Organização Mundial da Saúde exigem que a carne de tubarão contenha rótulos de advertência sobre os perigos do mercúrio e dos metais pesados na carne.
A maioria das organizações de saúde adverte que as mulheres em idade fértil e crianças não devem comer carne de tubarão e que outras não devem consumir mais do que 30 gramas por mês. Tubarões medindo mais de 43 polegadas de comprimento, de acordo com o Departamento de Saúde da Flórida, não devem ser usados para carne. Isso se deve ao fato de que os tubarões podem viver por 50 anos ou mais, e quanto mais velho e maior for o tubarão, mais mercúrio ele pode conter e mais prejudicial pode ser o consumo do tubarão para a saúde humana.