Potenciais impactos negativos da biotecnologia incluem riscos para humanos que comem alimentos derivados de plantas ou animais geneticamente modificados e risco de danos a plantas e ecossistemas nativos por plantas geneticamente modificadas. Também há preocupação de que os agricultores 'as finanças sofrem quando as empresas monopolizam as sementes modificadas ou outros produtos agrícolas.
As culturas geneticamente modificadas são os principais produtos da biotecnologia agrícola. Outra preocupação é o uso de hormônios em animais, como o hormônio de crescimento bovino recombinante artificial, que causa infecções e outros problemas de saúde em vacas. Os estudos não são conclusivos sobre se o câncer e outros possíveis efeitos negativos à saúde em humanos são causados pelo consumo de produtos alimentícios de animais tratados com hormônios artificiais.
Culturas geneticamente modificadas podem contaminar plantas naturais com pólen e genes geneticamente modificados, criar novas cepas de vírus ou ervas daninhas, interromper o controle natural de pragas e contaminar o solo com toxinas que podem prejudicar a cadeia alimentar. Essas toxinas podem prejudicar os trabalhadores agrícolas, suas famílias e outras pessoas da comunidade onde as safras geneticamente modificadas são cultivadas.
Limitar as safras dos agricultores a menos variedades geneticamente modificadas também limita a biodiversidade, o que é importante para resistir a secas e doenças que afetam as plantas. Se houver menos variedades ou espécies em um ecossistema, a população fica mais vulnerável a uma praga de monocultura que pode destruir um importante alimento básico.
Alguns países onde os OGM são vendidos carecem de supervisão e controle adequados dos organismos para proteger as pessoas e o meio ambiente.
