Congelar é uma opção viável para armazenar mexilhões frescos. Após o enxágue, coloque os mexilhões em um recipiente hermético ou em sacos de freezer com o líquido do mexilhão. Mexilhões congelados permanecem frescos por três meses.
Descongele mexilhões congelados por 24 horas na geladeira antes de apreciá-los ou cozinhá-los. Nunca descongele em temperatura ambiente para evitar possíveis doenças. Além disso, não congele novamente nenhum mexilhão que tenha sido descongelado.
Geralmente, a carne dos mexilhões congelados é mais macia do que a carne fresca, e esses mexilhões são melhor cozidos do que comidos crus. Assim que a carne estiver descongelada, ferva os mexilhões em uma panela pequena por até cinco minutos após a abertura das cascas.