Os efeitos colaterais indesejáveis do suco de beterraba incluem paralisia temporária das cordas vocais, toxicidade hepática, diarreia, vômitos, fezes vermelhas ou urina e aumento da tendência para cálculos renais ou biliares. O suco de beterraba é considerado um superalimento com muitos benefícios, mas consumir muito pode causar esses efeitos colaterais.
Existem maneiras de consumir suco de beterraba e limitar o risco de efeitos colaterais. Combinar suco de beterraba com suco de cenoura ou aipo pode reduzir as chances de paralisia das cordas vocais, por exemplo. Como o suco de beterraba é considerado um limpador poderoso, consumir grandes quantidades pode despejar toxinas no fígado que o fígado não consegue processar adequadamente. Pessoas com doenças conhecidas do fígado ou rins podem querer beber suco de beterraba em quantidades muito pequenas.
Os efeitos do vômito e da diarreia são causados pela eficácia concentrada do suco de beterraba e pelo forte impacto no intestino. É considerado uma cura para a constipação, mas aqueles com tendência para intestino solto ou com síndrome do intestino irritável podem achar a condição exacerbada pelo suco de beterraba.
O alto teor de oxalato no suco de beterraba aumenta a tendência do corpo de cristalizar minerais, aumentando assim as chances de cálculos renais ou biliares. Por causa de sua coloração vermelha profunda e natural, o suco de beterraba tem a tendência de tornar as fezes e a urina vermelhas. Isso pode parecer alarmante, mas não é perigoso.