Existem vários substitutos para a goma xantana na panificação, incluindo goma guar, ágar ágar e sementes como chia ou linho. A clara do ovo também substitui a goma xantana em certas receitas, como panquecas ou waffles.
A goma de guar é usada como alternativa à goma xantana na maioria das receitas sem glúten, especialmente recheios de pastelaria e sorvetes. Não é um bom substituto em pães de fermento, no entanto. O ágar ágar é melhor usado como um substituto para a goma xantana em massas. As sementes de chia e linho também funcionam bem como substitutos da goma xantana e engrossam a massa e batem facilmente, mas precisam ser bem trituradas para evitar uma consistência arenosa.
