Os amendoins orgânicos são cultivados sem fertilizantes sintéticos e pesticidas. A maioria dos amendoins orgânicos é cultivada nos climas áridos do Novo México e Arizona para minimizar a contaminação das lavouras por Aspergillus flavos, um fungo que carrega a toxina cancerígena, a micotoxina Aflatoxina, e outros fungos.
Os agricultores que cultivam amendoim orgânico usam técnicas inovadoras de manejo do solo e rotação agressiva de culturas para manter o solo e as plantas de amendoim saudáveis. Tanto os amendoins orgânicos quanto os não orgânicos têm o potencial de serem contaminados por mofo ou outros organismos quando transferidos do campo para o mercado. Os amendoins também podem ser contaminados pelo manuseio, processamento e armazenamento inadequados com mofo, salmonela, E. coli e outros organismos.
