As cebolinhas são preparadas lavando-as, aparando-as pela raiz e depois fatiando-as de acordo com a forma desejada. Assim como as cebolas vermelhas, brancas e amarelas, os caules e raízes das cebolinhas podem ser comidos crus ou cozidos. Essas cebolas são tão versáteis quanto suas primas maiores, mas mais delicadas e requerem preparação e armazenamento especiais.
As cebolinhas, como outros produtos, devem ser bem lavadas antes do consumo. O enxágue das cebolas livra-as de pesticidas e fertilizantes residuais e também pode levar a areia, sujeira e outros detritos orgânicos. Depois de lavar as cebolas, seque-as para remover o excesso de umidade. Se as raízes forem consumidas, certifique-se de cortar as raízes irregulares primeiro, pois as raízes são difíceis de mastigar e não são comidas normalmente. A parte bulbosa da cebola pode então ser fatiada, cortada em cubos ou picada de acordo com a necessidade de preparação. Os topos das cebolas podem ser cortados horizontalmente ou diagonalmente; esta etapa pode ser realizada com uma tesoura de cozinha ou colocando a cebola plana sobre uma tábua e cortando com uma faca. A parte superior da cebola também pode ser usada como guarnição. Para fazer isso, corte os topos em fios finos e coloque em água gelada por até 30 minutos.