Uma das principais diferenças entre amêijoas e ostras é que as amêijoas são móveis durante toda a vida, puxando-se pela areia com um pé que se estende bem para fora das suas conchas. Após um breve estágio larval no início da vida, as ostras se ligam a outras ostras ou rochas e vivem em um só lugar.
As outras diferenças entre amêijoas e ostras são variações sutis em espécies relacionadas de bivalves. Ambas as amêijoas e ostras são classificadas como moluscos, por isso têm anatomias semelhantes. Embora mariscos e ostras tenham duas conchas, ambas as conchas têm a mesma aparência. Uma das conchas da ostra é colocada em uma xícara, enquanto a outra é plana. A textura mais lisa das conchas de moluscos os ajuda a cavar na areia. Embora as ostras tenham uma guelra, a maioria dos mariscos filtra a nutrição e a água por meio de um sifão que se estende pela areia. Embora ambos possam viver em água salobra e salgada, muitas espécies de moluscos vivem em água doce. Como os mariscos geralmente vivem enterrados na areia e sedimentos e ostras vivem em águas abertas, suas dietas são ligeiramente diferentes. As diferenças na dieta são responsáveis pelas diferenças no sabor quando os crustáceos são consumidos. Além disso, suas carnes são de cores e texturas diferentes. A maioria das amêijoas é rosada e pegajosa, enquanto as ostras são cinza-escuras e macias.