Se não guarnecido e armazenado em um recipiente bem tampado, o cheesecake pode ser mantido na geladeira por até uma semana. Para reter o sabor e a textura ideais, ele deve ser armazenado na geladeira, no máximo duas dias antes de servir.
O cheesecake pode ser armazenado no congelador por um mês ou mais. É melhor remover as guarnições e embrulhar em uma camada de filme plástico seguido por uma camada de papel alumínio antes de colocá-la no freezer. Retirar o cheesecake do congelador na noite anterior, deixá-lo embrulhado e deixá-lo descansar na geladeira durante a noite para descongelar antes de servir fornece os melhores resultados.