As desvantagens do kefir incluem seu conteúdo de gordura saturada, densidade calórica relativamente alta e alta concentração de açúcar. O kefir também interage mal com certos medicamentos. As bactérias, leveduras e probióticos encontrados no kefir também podem causar problemas de digestão, como prisão de ventre, cólicas intestinais e dores de estômago.
Devido às bactérias criadas durante o processo de fermentação, o kefir pode causar doenças e infecções em pessoas com sistema imunológico comprometido. Também agrava os sintomas de distúrbios intestinais, como a doença de Crohn e a síndrome do intestino irritável.
Os potenciais efeitos colaterais são outra desvantagem do kefir. As bactérias e probióticos encontrados no kefir freqüentemente induzem vários efeitos colaterais desagradáveis, especialmente quando os usuários começam a beber o kefir. Os efeitos colaterais negativos incluem náusea, dor abdominal, dores de cabeça, diarreia, desconforto estomacal, distensão abdominal e gases. Algumas pessoas relatam problemas de pele como acne ou furúnculos.
O kefir também causa picos perigosos da pressão arterial em pessoas que tomam antidepressivos. Ele interfere na maioria dos medicamentos imunossupressores, incluindo basiliximabe, azatioprina, tacrolimo e prednisona. A pesquisa sugere que o kefir pode desencadear enxaquecas em alguns pacientes.
Além disso, não há provas concretas de que o kefir seja uma opção de tratamento adequada para qualquer condição médica. Apesar de inúmeras alegações, não há evidências de que o kefir melhora o colesterol alto, trata a diarreia induzida por antibióticos, cura a intolerância à lactose ou alivia feridas na boca.
