As enzimas são usadas pela indústria de alimentos para uma variedade de propósitos para ajudar a processar alimentos mais rapidamente e torná-los mais digeríveis. As enzimas podem ser naturais ou artificiais e geralmente são consideradas um aditivo alimentar.
Por centenas de anos, as enzimas têm sido usadas no processamento de alguns alimentos. Queijo, pão e vinho são três alimentos básicos que não seriam os mesmos sem a ação catalisadora de certas enzimas. O coalho é uma enzima protease encontrada nos estômagos dos animais domésticos, usada para separar o leite em coalhada e soro de leite. Coalhada é a base do queijo, comprimida em blocos ou rodelas e pode curar por várias semanas.
Os fabricantes de alimentos agora usam dezenas de enzimas diferentes para processar alimentos, fermentá-los e torná-los mais fáceis de digerir ou decompor os subprodutos para descarte. As proteínas enzimáticas são tão eficazes que uma pequena quantidade é capaz de acelerar drasticamente a produção de alimentos. Por exemplo, um pequeno pacote de coalho pode separar um barril de leite em algumas horas, ao passo que levaria dias para o leite se separar naturalmente.
Existem várias áreas onde as enzimas são utilizadas pelos fabricantes. Essas proteínas podem ser encontradas em panificação, processamento de óleo e gordura, fabricação de álcool, processamento de laticínios e produção de carne e peixe.