A maioria dos produtos de compota de maçã não contém conservantes, portanto, eles acabarão estragando e devem ser descartados. A maioria dos recipientes de compota de maçã, seja de dose única ou em pote, terá um best-by data, que deve ser anotada antes de comer.
Os recipientes fechados de compota de maçã podem permanecer bons para comer por até um ano, desde que os recipientes sejam mantidos em um local fresco e seco, como em uma despensa de cozinha em temperatura ambiente. Uma vez que um recipiente de compota de maçã é aberto, ele deve ser mantido na geladeira. Depois de aberto, o molho de maçã ainda é bom por até 10 dias. Como com qualquer coisa, se não se sabe por quanto tempo a compota de maçã ficou refrigerada ou se ela tem um cheiro ou sabor estranho, deve ser descartada imediatamente.
