Os efeitos colaterais do Mountain Dew incluem diabetes, obesidade, dentes ruins, pressão alta e outros problemas de saúde se as pessoas o bebem em grandes quantidades. Esses problemas de saúde estão diretamente relacionados às altas quantidades de açúcar e cafeína que Mountain Dew contém. Os efeitos colaterais do Mountain Dew são semelhantes aos de qualquer outro refrigerante.
Os consumidores costumam se preocupar com os efeitos colaterais do Mountain Dew e de outros refrigerantes amarelos por causa do mito urbano de que bebê-los diminui a contagem de espermatozoides do homem. Na verdade, muitas pessoas admitem que acreditam tanto neste mito que usam Mountain Dew como uma forma de contraceptivo. Esses crentes pensam que o Yellow Dye No. 5 usado na fabricação de Mountain Dew e outros refrigerantes amarelos tem propriedades espermicidas. Eles também apontam para o teor extremamente alto de cafeína da Mountain Dew.
De acordo com a Federal Drug Administration, Yellow Dye No. 5 não representa qualquer tipo de ameaça para os espermatozoides. Além disso, o FDA afirma que a cafeína pode melhorar a mobilidade do esperma em vez de matá-lo. Isso significa que beber grandes qualidades de Mountain Dew pode aumentar a eficácia do esperma. Mountain Dew tem cerca de 55 miligramas de cafeína por lata, enquanto uma Coca-Cola tem apenas 37,2 miligramas.