Exemplos de bactérias anaeróbias facultativas incluem Salmonella e E. coli. Bactérias anaeróbias facultativas são membros das famílias taxonômicas Enterobacteriaceae, Vibrionaceae e Pasteurellaceae. Muitas das espécies nessas famílias são patógenos em humanos, outros animais ou plantas.
Bactérias anaeróbicas facultativas são capazes de respiração aeróbica e fermentação ou respiração anaeróbica. Muitos organismos além das bactérias são anaeróbios facultativos e incluem alguns fungos e vermes poliquetas. Bactérias anaeróbicas faculativas são onipresentes e comuns no solo, na água e nos organismos. Nem todas as espécies causam doenças, mas fazem parte da flora intestinal normal dos animais. Algumas espécies, como E. coli, costumam ser inofensivas.
Enterobacteriaceae é a família que contém as bactérias comuns de origem alimentar Salmonella e E. coli, junto com muitos outros grupos de patógenos perigosos. As espécies de Vibrionaceae incluem o vibrio cholera, uma doença mortal transmitida por esgotos e alimentos contaminados. Esta espécie faz com que grandes quantidades de água sejam liberadas nos intestinos, levando à rápida desidratação. Vibrionaceae também inclui fotobactérias, um grupo que produz luz e pode ser encontrado nos órgãos produtores de luz de alguns peixes do fundo do mar. Pasteurellaceae inclui espécies de pastuerella, que são patógenos comuns de animais domésticos, bem como haemophilus, que são comuns no trato respiratório superior e requerem um componente de hemoglobina para sobreviver.
