As quatro etapas da oxidação beta são desidrogenação, hidratação, uma segunda desidrogenação e clivagem tiolítica, observa a Biblioteca de Ciências da Saúde da Universidade de Utah. Uma enzima separada catalisa cada etapa.
A primeira etapa é a desidrogenação, e esta etapa ocorre entre os carbonos alfa e beta em uma reação ligada ao FAD, conforme explicado em Study.com. A próxima etapa é a hidratação, pois a enzima Enoyl-CoA devolve um hidrogênio ao carbono alfa e adiciona oxigênio ao carbono beta. Em seguida, uma segunda desidrogenação ocorre em uma reação ligada ao NAD. Durante a fase final, ocorre uma reação catalisada por tiolase que cliva o beta-cetoacil-CoA.