A água do vaso sanitário contém quantidades significativas de bactérias. Um dos mais comuns, C. difficile, causa uma quantidade significativa de diarreia e vômito e expele até 30 centímetros acima do assento do vaso sanitário quando as pessoas dão descarga enquanto a tampa está aberta, de acordo com a Prevenção.
O banheiro não precisa estar em uso para a presença de bactérias. Cientistas da Universidade de Leeds encontraram bactérias na parte superior e nas laterais do vaso sanitário e no chão, mesmo quando ninguém dava descarga há algum tempo. Os níveis de bactérias atingem seu nível mais alto logo após a lavagem, mas gotículas contaminadas aparecem nas superfícies próximas até cerca de uma hora após a última lavagem. Manter a tampa fechada é uma ótima maneira de controlar a propagação dessa bactéria.
