Eubactérias e arqueobactérias têm uma grande variedade de formas. No entanto, esses tipos de células não têm organelas ligadas à membrana, não organizam seu DNA em um núcleo e são contidos por membranas celulares protegidas pelas paredes celulares. Ambos são relativamente simples na estrutura, então a maioria de suas diferenças são químicas, não estruturais. Em geral, as arqueobactérias têm semelhanças com os eucariotos que faltam às eubactérias, mas também apresentam algumas características verdadeiramente únicas.
Em comparação com as arqueobactérias, as eubactérias são extremamente diversas e disseminadas, mas têm apenas três formas celulares principais. Eles são esféricos, em forma de hastes curtas, ou longos e tortuosos. Essa forma básica é uma grande parte da classificação das eubactérias. As arqueobactérias, por outro lado, não são classificadas pela forma, mas pelo tipo de extremófilo que são. As arqueobactérias vivem em ambientes hostis onde nem as eubactérias nem os eucariotos podem sobreviver. Eles são classificados como produtores de metano, especialistas em calor extremo ou especialistas em salinidade extrema.
Parte do que faz com que as arqueobactérias sobrevivam em ambientes tão extremos são suas membranas celulares exclusivas. Enquanto todas as eubactérias e eucariotos têm bicamadas fosfolipídicas como membranas celulares, as arqueobactérias têm cadeias de hidrocarbonetos ramificadas com ligações de éter ao glicerol em suas membranas. Este tipo de membrana exclusivo é mais estável do que aqueles em outras formas de vida e permite que resistam a condições extremas.
