Doenças que atormentaram os primeiros colonos americanos incluíam tifo, também conhecido como febre tifóide ou febre maculosa, bem como malária e encefalite. A disenteria e a hipernatremia também conhecidas como envenenamento por sal também representam uma ameaça notável para o saúde dos americanos coloniais.
A varíola também era uma ameaça sinistra na época. Uma epidemia de varíola na Williamsburg colonial de 1747 a 1758 afetou 754 pessoas. Grandes populações de nativos americanos foram exterminadas durante o período colonial, quando contraíram doenças, incluindo varíola. Epidemias de doenças introduzidas pelos europeus reduziram a população de nativos americanos na Nova Inglaterra em 90 por cento entre 1615 e 1633.