Os organismos unicelulares comem usando um processo chamado fagocitose. Esse processo permite que o organismo unicelular leve o alimento para a parte interna da célula para digestão.
Uma combinação de produtos químicos na superfície do organismo unicelular, bem como no alimento desejado, permite que o organismo reconheça o alimento e se ligue à substância que está tentando comer. Uma vez aderido, o organismo envolve sua camada externa, que é chamada de membrana celular externa, completamente ao redor da partícula alimentar. Uma vez que o alimento foi engolfado pela membrana celular externa, a membrana se comprimiu em direção ao interior da célula, criando um saco dentro da célula que contém o alimento chamado vacúolo. O vacúolo e o alimento juntos são chamados de fagossoma.
O fagossoma então entra em contato com um lisossoma. Um lisossoma é um vacúolo que contém enzimas. O lisossoma então injeta essas enzimas no fagossoma e, uma vez dentro, as enzimas decompõem o alimento em moléculas individuais. Quando restam apenas organismos individuais do alimento, considera-se que ele foi digerido ou comido. Essas moléculas podem ser usadas para alimentar e construir qualquer coisa de que o organismo unicelular precise.