A principal função dos pulmões de um rato é apoiar a respiração. A respiração é realizada por meio da respiração, na qual o ar entra no corpo pelo nariz ou boca, desce pela traqueia e chega aos brônquios dos pulmões .
Os alvéolos, pequenos ramos dos brônquios, são projetados especificamente para realizar a troca gasosa no nível celular. O oxigênio nos alvéolos entra na corrente sanguínea por difusão e o dióxido de carbono entra nos pulmões. Este dióxido de carbono é expelido quando o rato expira.
Os pulmões são rodeados por costelas e pelo diafragma muscular. O diafragma se contrai durante a inspiração, criando pressão negativa e puxando o ar para os pulmões. Quando o diafragma relaxa, ocorre a expiração.