Os fatores abióticos de um estuário são profundidade da água, salinidade, nutrientes, temperatura do ar e da água, pH da água, oxigênio dissolvido e turbidez ou nebulosidade. Nutrientes são substâncias na água, como como nitrogênio e fósforo, disponível para os organismos como alimento.
Um estuário é um ecossistema onde a foz de um rio ou riacho encontra a maré. Um fator abiótico é uma parte não viva de um ecossistema. Para determinar a saúde dos estuários, os cientistas monitoram os fatores abióticos e os seres vivos ou fatores bióticos.
O pH mede a acidez ou alcalinidade. Um valor de pH de 7 é neutro. Valores acima de 7 são alcalinos e menos de 7 são ácidos. Se a água for muito ácida ou alcalina, alguns tipos de organismos não prosperam.
Os estuários são o lugar principal no ciclo de nutrientes da natureza, que tornam muitos elementos disponíveis para os organismos como alimento. Em um estuário saudável, os elementos permanecem em equilíbrio. Muito nitrogênio, por exemplo, e o número de algas podem explodir, usar o excesso de nutrientes e, em seguida, morrer e usar muito oxigênio ao se decompor. Quando as algas usam muito alimento e oxigênio, elas podem negá-los a outros organismos. Além disso, a proliferação de algas faz com que o pH suba. Se a floração for severa, o aumento do pH pode matar animais aquáticos.
A turbidez é uma medida de matéria suspensa na água. Se a água estiver muito turva, pouca ou nenhuma luz solar pode penetrar para nutrir as plantas aquáticas, das quais outros organismos se alimentam e que fazem a tarefa necessária de
oxigenando a água.
