Exemplos de fungos saprofíticos podem incluir Rhizobium e Rhizopus. Os organismos saprofíticos são caracterizados por sua capacidade de se sustentar alimentando-se de materiais orgânicos mortos e em decomposição.
Fungos, como o Rhizobium, ajudam a sustentar a vida das plantas, fornecendo amônia para a vegetação circundante, utilizando o nitrogênio absorvido do ar. Rhizopus é um fungo comumente encontrado no pão que faz com que ele se decomponha em nutrientes mais simples para serem usados por outros organismos. Os fungos saprofíticos são essenciais para o ecossistema devido à sua função de prevenir o acúmulo de matéria orgânica morta e a reciclagem de nutrientes. Eles usam enzimas para quebrar os corpos de animais mortos ou matéria vegetal em nutrientes, como a lignina, que servem como fonte de carbono para o ecossistema.