Os dois tipos principais de respiração anaeróbica são a fermentação alcoólica e a fermentação de ácido lático. Esses métodos de respiração ocorrem quando a quantidade de oxigênio disponível é muito baixa para suportar a respiração aeróbica.
A fermentação alcoólica converte glicose em etanol. Na fermentação alcoólica, a glicose é quebrada pela glicólise e duas moléculas de ATP são liberadas no processo. As moléculas de ácido pirúvico produzidas durante a glicólise se decompõem em etanol e dióxido de carbono. Em animais, o processo de fermentação do ácido lático, da mesma forma, ocorre após o processo de glicólise. O ácido pirúvico é transformado em ácido láctico e o tecido muscular é decomposto pelo ácido láctico. A fermentação do ácido láctico é a razão pela qual os músculos queimam durante um treino intenso ou longo. A degradação dos músculos com ácido lático resulta na reconstrução do tecido muscular para se tornar mais forte.