A principal desvantagem da mineração industrial são os danos que as operações de mineração causam ao meio ambiente. A remoção de grandes áreas da camada superficial do solo pode destruir habitats, e os produtos químicos usados nas operações de mineração podem vazar para as águas subterrâneas e poluir a área. A poluição do ar e a poluição radioativa são outras desvantagens possíveis.
Outro perigo potencial é a instabilidade geológica. Em 1980, uma mina de sal embaixo do Lago Peigneur, na Louisiana, desabou quando uma operação de perfuração de petróleo rompeu parte da mina, e o colapso resultante sugou barcaças, veículos e edifícios. Depois que o lago assentou, todo o litoral e a região foram drasticamente alterados pelo colapso.