Alguns aspectos negativos das dietas com baixo teor de gordura incluem o incentivo ao consumo de alimentos prejudiciais, o aumento dos triglicerídeos, a prevenção de alimentos saudáveis e a redução do HDL, ou colesterol "bom". Além disso, as dietas com baixo teor de gordura podem diminuir os níveis de testosterona e podem levar a doenças cardíacas.
Embora os fabricantes possam ter as melhores intenções das pessoas em mente, não há como negar que os produtos sem a gordura não têm um sabor tão bom. Para compensar isso, os produtores costumam embalar esses alimentos "com baixo teor de gordura" com açúcar. O resultado disso é que os alimentos rotulados como "com baixo teor de gordura" podem conter uma quantidade prejudicial de açúcar. As dietas com baixo teor de gordura também promovem o consumo de trigo integral e óleo vegetal. O trigo integral, que contém glúten, causa uma reação adversa em algumas pessoas, enquanto os óleos vegetais estão associados a inflamações e doenças cardíacas a longo prazo.
Altos níveis de triglicerídeos também podem causar doenças cardíacas. As dietas com baixo teor de gordura, geralmente ricas em carboidratos, costumam elevar o nível de triglicerídeos de um indivíduo. Como as dietas com baixo teor de gordura podem conter alimentos prejudiciais, também podem evitar alimentos saudáveis, como ovos, carne e laticínios, que são excelentes fontes de vitaminas e minerais necessários. Em termos de HDL, ou colesterol "bom", comer gordura pode realmente aumentar esses níveis, enquanto estudos mostram que uma dieta com baixo teor de gordura os reduz.