De acordo com o Tusculum College, homólogos, ou cromossomos homólogos, separam-se durante a anáfase I da meiose I. BiologyCorner.com afirma, "as fibras do fuso movem os cromossomos homólogos para lados opostos." Durante a metáfase II, os cromossomos se alinham novamente, mas não em pares homólogos.
A separação dos cromossomos homólogos permite que cada homólogo alcance cada gameta. Isso permite que cada célula filha tenha apenas 23 cromossomos, que é um de cada par homólogo. As cromátides irmãs permanecem intactas durante a meiose I, mas se dividem durante a meiose II. Depois de ocorrer o cruzamento, as cromátides se separam durante a anáfase II e se alinham ao longo do equador durante a metáfase I da meiose I.