Os fungos obtêm comida decompondo e consumindo matéria orgânica. A maioria dos fungos decompõe organismos mortos, enquanto alguns são mutualísticos ou parasitas com outros organismos. Os fungos armazenam energia de maneira semelhante aos animais.
Os fungos incluem organismos, como leveduras, mofo e cogumelos. A maioria dos fungos é multicelular, exceto as leveduras. Todos os fungos dependem de outros organismos para obter alimento, e a maioria o faz por meio da digestão de material morto. Essa capacidade os torna decompositores importantes em muitos ecossistemas. Um excelente exemplo de nutrição fúngica é o aparecimento de cogumelos em troncos caídos em uma floresta. A parte visível do cogumelo é na verdade a estrutura reprodutiva. As estruturas de alimentação, ou hifas, penetram profundamente na madeira apodrecida para obter nutrientes.
Os fungos ajudam a decompor o material orgânico morto e a devolver nutrientes ao solo para uso no ecossistema. Alguns fungos coabitam com outros organismos de forma que ambos se beneficiam. Um exemplo disso é a relação mutualística entre fungos e algas para formar um líquen. As algas passam pela fotossíntese e fornecem nutrientes para algas e fungos, enquanto o fungo protege as algas. Pesquisas recentes sugerem que algumas algas crescem com mais sucesso quando separadas de seu parceiro fúngico, o que implica que alguns líquenes são exemplos de parasitismo. Um exemplo melhor de parasitismo fúngico é o Pseudogymnoascus destructans, o fungo responsável por causar a síndrome do nariz branco em morcegos que hibernam. Este fungo é oportunista e capaz de se alimentar de tecidos vivos ou mortos. Em morcegos vivos, ele penetra na pele e rouba nutrientes e eletrólitos vitais do morcego.
