A temperatura afeta a porcentagem de sementes que germinam e a taxa de germinação. As sementes mantidas em altas temperaturas têm maior probabilidade de se deteriorar e não germinar. Uma vez que as sementes começam a germinar, temperaturas mais altas estimulam uma germinação mais rápida até uma temperatura ideal, após a qual a velocidade de germinação diminui.
A temperatura ideal para a velocidade de germinação varia de acordo com a espécie. As sementes secas têm maior probabilidade de germinar em temperaturas mais altas, mas as sementes úmidas têm menos probabilidade de germinar em temperaturas mais altas. A alternância entre temperaturas quentes e frias provavelmente estimulará a germinação de muitas sementes úmidas. Algumas espécies de sementes são estimuladas a germinar por temperaturas muito frias.