Muitas atividades humanas causam poluição, destruição de habitat e mudanças climáticas, todas destrutivas para os ecossistemas. De acordo com o World Wildlife Fund, o uso de pesticidas e fertilizantes em fazendas aumentou 26 vezes nos últimos 50 anos, o que tem causado danos crescentes a riachos, rios, lagos e oceanos do mundo. Os fertilizantes são tóxicos para muitos tipos de vida aquática e alteram a química das águas locais.
Outra forma pela qual os humanos podem prejudicar os ecossistemas é através da introdução de espécies não nativas. A National Wildlife Federation sugere que as espécies invasoras se espalham por meio do comércio de animais de estimação, em barcos e junto com plantas ornamentais importadas. Essas espécies invasoras podem deslocar espécies nativas, alterando o equilíbrio do ecossistema. As espécies invasivas assumem várias formas, desde peixes grandes, como a carpa asiática, até vírus microscópicos, como o vírus do Nilo Ocidental.
O tratamento inadequado dos resíduos sólidos pode causar uma série de problemas para os ecossistemas aquáticos. O World Wildlife Fund explica que grandes acúmulos de plástico podem se formar no oceano, o que pode liberar produtos químicos nocivos na água, danificar recifes de coral ou ferir animais que o ingerem inadvertidamente.
A poluição do ar também prejudica os ecossistemas naturais. De acordo com o World Wildlife Fund, a chuva ácida, causada quando os humanos liberam dióxido de enxofre no ar, também é prejudicial aos habitats naturais do mundo.
