Os protistas servem a vários propósitos no ecossistema, incluindo a produção de 70 a 80 por cento do oxigênio do mundo, sendo a principal fonte de alimento para animais aquáticos e um importante agente de decomposição de material morto. Os protistas podem chegar ao fim a 300 pés de comprimento, como no caso das algas gigantes das florestas de algas do Oceano Pacífico.
Os protistas também desempenham um papel no ecossistema devido ao seu papel nas doenças. Algumas das doenças com as quais estão associados incluem malária e doença do sono. Os protistas também podem ser usados para criar vacinas para essas mesmas doenças. Existem alguns usos cotidianos mais simples para protistas também, incluindo espessantes de sopa, filtros e produtos de polimento.
