O muco do estômago protege as células gastrointestinais dos danos que os sucos gástricos podem causar. Os sucos gástricos são altamente ácidos e, sem esse muco, o ácido pode destruir as células e tecidos do estômago.
O muco do estômago é rico em bicarbonato, um composto alcalino, para ajudar a lubrificar e proteger o estômago. O ácido do estômago vem das células parietais, um tipo de célula do estômago, e é um ácido clorídrico, que é uma solução de água e cloreto de hidrogênio. Isso permite que o ambiente do estômago seja altamente ácido. Um alto nível de acidez é fundamental para inativar bactérias nos alimentos que as pessoas comem e para ativar o pepsinogênio, um tipo de enzima.