O cloro pode matar microorganismos benéficos no solo, afetando assim o crescimento das plantas; no entanto, a maior parte da água potável clorada não é concentrada o suficiente para afetar adversamente a vida das plantas em uma determinada área. Isso se deve ao fato de que a taxa de reprodução de microorganismos no solo é tão alta que eles tendem a se reproduzir novamente antes do planta pode ser afetada negativamente pelo solo.
A maioria das comunidades adiciona pequenas quantidades de cloro à água potável para garantir a segurança dos residentes. A água potável típica não contém grandes quantidades de cloro para eliminar verdadeiramente os microorganismos benéficos do solo, afetando minimamente o crescimento das plantas. Microrganismos benéficos encontrados no solo se reproduzem em taxas tão altas, tornando os efeitos da água clorada quase discutíveis.
O cloro também se liga às superfícies das partículas do solo, o que reduz a capacidade do cloro de destruir microorganismos benéficos. Além disso, conforme a água clorada desce para níveis mais baixos de solo, o cloro se liga às superfícies dessas partículas de solo, o que significa que a água contém menos cloro à medida que desce. Estudos mostram que o solo submetido à água potável clorada exibiu apenas uma redução de microorganismos na parte superior de 1/2 polegada do solo. Os microrganismos em níveis de solo mais profundos que 1 polegada não foram afetados pelo cloro.