O corte seletivo permite que os ecossistemas sustentem mais vida selvagem do que o corte raso e permite que as florestas mantenham parte de sua resistência a doenças e pragas. Além disso, estudos mostram que os níveis de absorção de carbono se recuperam rapidamente se o corte seletivo for feito de maneira adequada. Algumas das desvantagens são que algumas espécies podem não se regenerar rapidamente e o desbaste da floresta pode levar ao aumento dos danos causados pelo gelo, tempestades ou incêndios.
Uma das maiores vantagens do corte seletivo é que o impacto ecológico geral na floresta é reduzido. Embora o processo seja invasivo, uma floresta com corte seletivo é capaz de suportar muito mais espécies do que uma floresta com corte raso. Além disso, o corte raso de uma floresta a deixa muito mais vulnerável a doenças do que o corte seletivo. Em algumas áreas, o corte de árvores antigas pode deixar espaço para novas espécies que são capazes de lidar com a sombra melhor do que as árvores originais. Finalmente, uma pesquisa feita na Amazônia por Michael Goulden, da Universidade da Califórnia em Irvine, sugere que as florestas recuperam a maior parte de sua capacidade de absorver dióxido de carbono logo depois de serem cortadas seletivamente.
No entanto, ainda existem desvantagens para o corte seletivo. Existem algumas espécies de árvores, nomeadamente pinheiros, abetos e sequoias, que não se regeneram bem após o corte seletivo. Isso significa que a composição geral de uma floresta pode mudar após o corte seletivo. Tempestades de vento e gelo podem danificar as áreas abertas deixadas pelo corte seletivo. O fogo também é um risco após o corte seletivo, porque o solo seca e é mais provável que ocorram incêndios. Finalmente, embora uma floresta possa ser capaz de recuperar sua absorção de carbono rapidamente após o corte seletivo, uma floresta que cresceu novamente após ser cortada não tem toda a diversidade de uma floresta antiga.
