As principais desvantagens do uso de fertilizantes artificiais ou inorgânicos, de acordo com a Clemson University Extension, é que eles correm o risco de poluir as águas subterrâneas e alguns fertilizantes inorgânicos podem prejudicar as plantas se permanecerem na folhagem. Além disso, eles não adicionam tantos nutrientes ao solo quanto os fertilizantes orgânicos e precisam ser aplicados com mais frequência do que os fertilizantes naturais, de acordo com a extensão da Oregon State University.
Os nutrientes dos fertilizantes artificiais não permanecem no solo por muito tempo. Por esse motivo, os jardineiros devem aplicar fertilizantes inorgânicos em seu solo com mais freqüência do que fertilizantes orgânicos. Fertilizantes inorgânicos que liberam seus nutrientes no solo mais lentamente e, portanto, requerem menos aplicações, estão disponíveis em alguns fabricantes.
Os fertilizantes artificiais passam por um processo de fabricação, enquanto os fertilizantes orgânicos, como o estrume, normalmente não passam por esse tipo de tratamento. O processo de tratamento cria fertilizantes que são muito ricos nos três nutrientes primários de que as plantas precisam, que são nitrogênio, fósforo e potássio. Como os fertilizantes inorgânicos têm altas concentrações desses minerais, eles funcionam mais rapidamente do que fertilizantes como esterco e composto. É por isso que os fertilizantes artificiais são tão populares entre os jardineiros e fazendeiros, apesar de suas desvantagens potenciais.
