As coníferas ficam castanhas devido a pragas, doenças ou condições de cultivo desfavoráveis, como seca, geada e ventos frios. O pulgão cipreste é uma praga comum que causa o escurecimento das coníferas. Às vezes, também pode ser causado por erros nas rotinas de aparar, como aparar demais e aparar na época errada do ano.
O escurecimento das coníferas pode ser evitado seguindo o procedimento e tempo adequados ao aparar as sebes. É melhor aparar apenas duas ou três vezes por ano e nunca durante o tempo quente ou no outono. Quando já há algum escurecimento nas árvores, isso pode ser controlado com soluções não químicas, como amarrar brotos saudáveis para preencher áreas nuas. O escurecimento causado por pragas pode ser remediado com o uso de um inseticida, que deve ser aplicado o mais cedo possível.
