A sequência de Shine-Dalgarno é um arranjo específico de nucleotídeos rico em purinas no mRNA procariótico que direciona o RNA a uma pequena subunidade ribossômica para tradução. Esta sequência é necessária para que a ligação ribossômica e a síntese de proteínas ocorram em células procarióticas. É também conhecido como sítio de ligação ao ribossomo.
A sequência de Shine-Dalgarno está localizada a montante de onde ocorre a tradução do mRNA em proteínas, na região 5 'não traduzida, ou 5' UTR. Existem vários arranjos de nucleotídeos que podem direcionar mRNA procariótico para ribossomos para que a tradução ocorra, e várias sequências de Shine-Dalgarno foram descritas por cientistas. Normalmente, a sequência é vista aproximadamente oito a 10 códons a montante do códon de iniciação AUG que sinaliza o início da tradução de mRNA procariótico. Apesar de haver várias sequências de Shine-Dalgarno, todas compartilham uma sequência de consenso de seis nucleotídeos em uma ordem específica: AGGAGG.
A introdução de mutações na sequência Shine-Dalgarno pode ter efeitos diferentes dependendo do tipo de mutação e de sua localização. Uma mutação na sequência pode aumentar a taxa de tradução, diminuir a taxa ou não ter impacto.
A sequência Shine-Dalgarno foi descrita pela primeira vez pelos cientistas australianos John Shine e Lynn Dalgarno. A sequência também foi vista em arqueas.
