A forma de uma proteína é determinada pelos quatro níveis de estrutura da proteína: primária, secundária, terciária e quaternária. Outras proteínas chaperon estão presentes na célula e garantem que uma proteína se dobre em seu forma adequada.
As proteínas são compostas por polipeptídeos nos quais uma sequência de aminoácidos é conectada por meio de ligações peptídicas. Esta sequência é designada por estrutura primária de proteínas. A estrutura primária é mais freqüentemente relatada por meio de abreviações de uma ou três letras para os aminoácidos, listados começando do lado N-terminal. A estrutura secundária é um segmento regularmente dobrado de uma proteína, formado por ligações de hidrogênio entre os átomos do esqueleto dos aminoácidos. Os dois tipos principais de estrutura secundária são as hélices alfa e as folhas beta. Uma alfa hélice contém 3,6 aminoácidos por volta helicoidal. O aminoácido prolina não se encaixa em uma hélice devido à sua estrutura rígida. As folhas beta contêm cadeias de ligações peptídicas que se alinham lado a lado. Eles podem ser paralelos, em que os dois fios se alinham direcionalmente, ou um paralelo, em que cada folha é direcionada de forma oposta.
A estrutura terciária é a estrutura tridimensional de toda a cadeia peptídica. Em diagramas de proteínas, as hélices alfa são geralmente mostradas como bobinas e as folhas beta são mostradas como uma fita plana. A estrutura terciária é mantida pelas interações das cadeias laterais de aminoácidos, conforme determinado por suas características. A estrutura quaternária está presente em proteínas que contêm mais de uma cadeia polipeptídica, denominada domínio. É o arranjo espacial dos domínios.