A chuva ácida ameaça e danifica o ecossistema. Pode retardar o crescimento das árvores, alterar a acidez da água e causar a liberação de substâncias tóxicas do solo, prejudicando muitos animais aquáticos e seres vivos. Também enfraquece os materiais e acelera a erosão natural das estruturas de concreto.
Os efeitos da chuva ácida são mais palpáveis em ambientes aquáticos, como pântanos, rios, lagos e riachos. A maioria das águas superficiais tem um nível de pH entre 6 a 8; quando a chuva ácida cai diretamente na água ou escorre da terra e atinge os riachos, a acidez da água aumenta. Uma massa de água com um baixo nível de pH não pode sustentar uma nova vida. Pântanos, com seus ecossistemas frágeis, podem sofrer mais com a perda de uma espécie de peixe, pois os animais nesses ecossistemas dependem uns dos outros para prosperar.
A chuva ácida também impede que as plantas e árvores cresçam de forma saudável. Quando a chuva ácida cai sobre as folhas, ela desgasta a camada protetora das folhas e as impede de fotossintetizar corretamente. Conforme a chuva ácida goteja até o solo, ela ativa substâncias nocivas, como o alumínio, no solo e, em seguida, encontra seu caminho em riachos e lagos. A chuva ácida também dissolve os nutrientes e minerais do solo que ajudam a promover o crescimento das plantas e árvores.
