Embora a maioria dos muffins de farelo seja feita com ingredientes saudáveis, o tamanho da porção contribui para seu alto teor de calorias, de acordo com a Cooking Light. Alguns muffins de farelo podem ultrapassar 350 calorias.
Os vendidos em cadeias alimentares populares também têm um alto teor de sódio, com até 600 miligramas de sódio em um muffin, ou cerca de um terço da necessidade diária máxima.
Os muffins de farelo também podem ser ricos em gordura, açúcar e calorias, conforme observado por Greatist. Devido ao grande tamanho das porções, marcas como o muffin Honey Raisin Bran vendido no Dunkin 'Donuts têm cerca de 440 calorias, em contraste com o donut Kreme da Baviera, que tem 270 calorias. Queques de farelo comprados em lojas também podem ser carregados com açúcar. Por exemplo, o muffin de farelo de maçã da Starbuck contém 34 gramas de açúcar, ou o equivalente a 17 pacotes de açúcar. Muffins com frutas secas ou nozes como ingredientes adicionados podem ter contagens de calorias e de açúcar ainda mais altas.
Queques de farelo caseiros que são controlados por porção e ingrediente podem ser uma alternativa viável. O próprio farelo é saudável e rico em ômega, proteínas, fibras e minerais, afirma Greatist. Escolher receitas saudáveis de muffins é uma forma de reduzir a gordura, o açúcar e o sódio.