A atividade humana afeta os ecossistemas de várias maneiras, mas principalmente por meio da agricultura, destruição do habitat, uso da água e pesca. Sempre que os humanos entram em um habitat, eles tendem a remodelá-lo para se ajustar suas próprias necessidades, destruindo os recursos que outros animais usam, o que os expulsa. O uso excessivo de água drena os aqüíferos naturais e altera o lençol freático local, e a poluição pode afetar negativamente as populações de animais selvagens.
A pesca é uma área em que a atividade humana pode ter efeitos massivos em um ecossistema. Os humanos freqüentemente colocam extrema pressão sobre as espécies de predadores do ápice, como o atum. Quando o número desses predadores diminui, os predadores menores que eles consomem aumentam em número, o que pressiona as espécies mais abaixo na cadeia alimentar. Além disso, as operações de pesca industrial podem danificar habitats e matar espécies não relacionadas que são capturadas junto com os peixes visados.
Os humanos também afetam o meio ambiente por meio da poluição, e essas mudanças podem ser generalizadas. Os aumentos de dióxido de carbono e outros gases de efeito estufa aumentaram as temperaturas globais e esses aumentos podem alterar os níveis do mar e os padrões climáticos. Apenas alguns graus de mudança podem danificar ecossistemas frágeis, eliminando a flora importante ou alterando os ciclos reprodutivos dos animais, e o fato de que esses gases podem afetar o meio ambiente por décadas, senão séculos, garante que seu impacto seja de longo prazo e generalizado.