O bolor do pão se reproduz assexuadamente, usando mitose para formar esporos, e sexualmente. A reprodução sexual envolve o contato entre cepas de acasalamento opostas do fungo para formar um zigosporo.
O bolor do pão, Rhizopus stolonifer, reproduz-se mais frequentemente de forma assexuada. A reprodução começa logo após o molde de pão encontrar um substrato adequado e enviar suas estruturas de alimentação, ou hifas, para absorver nutrientes. O fungo nutrido forma estruturas verticais que contêm os esporos do fungo. Esses esporos são produtos da mitose e permanecem com o fungo até que as condições sejam adequadas para sua liberação; geralmente, os esporos são liberados quando o tempo está quente e seco. Os novos esporos agora pousam em um novo substrato e o ciclo de vida do fungo continua.
O molde do pão não tem sexos opostos como os animais e algumas plantas, mas tem duas linhagens de acasalamento. Quando as cepas opostas crescem próximas umas das outras, hormônios especiais fazem com que elas se toquem. Quando eles se tocam, os citoplasmas de suas células se combinam e seus núcleos se encontram e se unem. A união dos núcleos causa a formação de um zigósporo. Essa estrutura tem uma parede celular muito espessa e a capacidade de permanecer dormente; essas características permitem que um zigósporo sobreviva a condições difíceis. Quando as condições são favoráveis, a meiose ocorre dentro do zigósporo para criar esporos para liberação pelo fungo.
