Thomas Jefferson acreditava em um sistema federal que apoiava principalmente os direitos dos estados de se governarem. Alexander Hamilton acreditava em um governo central forte, com poderes de longo alcance para garantir os direitos do povo.
Os dois homens também lutaram nas finanças e na indústria. Alexander Hamilton apoiou a formação de um banco nacional e queria tomar medidas para encorajar a facilitação de uma forte indústria mercantil. Thomas Jefferson, por outro lado, acredita que a economia dos EUA poderia se sustentar por meio de seus esforços agrícolas. Jefferson acreditava que a ideia de governo de Hamilton era muito semelhante ao sistema monárquico da Inglaterra e expressou sua preocupação ao então presidente George Washington. Alexander Hamilton expressou preocupação com as idéias de Jefferson. A disputa dos dois homens sobre essas questões levou à formação dos primeiros partidos políticos dentro do governo dos EUA e à instituição de um candidato a vice-presidente à chapa presidencial. Até então, a pessoa com mais votos em uma eleição se tornava o presidente, e a pessoa com o segundo maior número de votos se tornava o vice-presidente. Thomas Jefferson se tornou o terceiro presidente dos Estados Unidos. Em 1804, Alexander Hamilton se envolveu em um duelo infame contra Aaron Burr, que também foi sobre diferenças políticas. Burr morreu como resultado do ferimento à bala que recebeu durante o duelo.