A maior parte do ATP para a respiração aeróbica é produzida durante o Ciclo de Krebs, também chamado de ciclo do ácido cítrico, que decompõe o piruvato, o produto final da glicólise, para produzir ATP. Este processo é duplicado. duas vezes para que possa produzir o dobro de ATP dos ciclos anteriores.
A glicólise produz entre seis e oito ATP no primeiro ciclo, que também produz o piruvato, que é transformado em acetil COA. Esses COA são processados para produzir outros seis ATP antes que o restante do COA seja processado no ciclo do ácido cítrico. O ciclo produz seis NADH, dois FADH2 e dois ATP. O NADH produz 18 ATP por conta própria, então o FADH2 produz outros quatro para ir com os outros dois ATP produzidos neste ciclo.
