O comandante-chefe do Exército Confederado foi Jefferson Davis, que também foi o presidente dos Estados Confederados da América de 1861 a 1865. Houve muitos líderes do Exército Confederado que serviram sob Jefferson Davis. Alguns generais confederados famosos foram Robert E. Lee, John Bell Hood, Thomas "Stonewall" Jackson e Braxton Bragg.
Enquanto Bragg liderava o Exército do Tennessee em 1862, Jackson lutou na Primeira Batalha de Bull Run. O General Lee foi um comandante fundamental durante a Guerra Civil. No final da guerra, ele entregou a última das forças confederadas em Appomattox ao general Ulysses S. Grant em abril de 1865.
A Guerra Civil durou de 1861 a 1865. Em termos de mão de obra, as forças do sul foram superadas em número de dois para um. Foi uma guerra cara, na qual morreram cerca de 620.000 soldados.