De acordo com o Banco de Dados de Répteis, a maioria das cobras tem 36 pares de cromossomos. Vinte dos cromossomos são considerados microcromossomos, enquanto o restante são chamados de macrocromossomos. No entanto, o termo "cobras" se refere a mais de 3.400 espécies diferentes e muitas não tiveram seu cariótipo estudado, portanto, algumas variações podem existir.
Em contraste com muitos répteis, como crocodilos, tartarugas e algumas lagartixas, o sexo das cobras é determinado por seus cromossomos, e não pelas condições ambientais que cercam os ovos em desenvolvimento. No entanto, as cobras exibem o padrão inverso do que é demonstrado pelos humanos. Enquanto os machos humanos são do sexo heterogamético, apresentando um cromossomo X e Y, as cobras fêmeas são do sexo heterogamético e apresentam um cromossomo Z e W.